Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFT172Q9UG01 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFT172Q9UG01 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms