Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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RNF7Q9UBF6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF7Q9UBF6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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