Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD5

ORC3, Origin recognition complex subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ORC3Q9UBD5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ORC3Q9UBD5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ORC3Q9UBD5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ORC3Q9UBD5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ORC3Q9UBD5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ORC3Q9UBD5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ORC3Q9UBD5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ORC3Q9UBD5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ORC3Q9UBD5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ORC3Q9UBD5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ORC3Q9UBD5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ORC3Q9UBD5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ORC3Q9UBD5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ORC3Q9UBD5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ORC3Q9UBD5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms