Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC88CQ9P219 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms