Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SH3BP4Q9P0V3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms