Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RDH8Q9NYR8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms