Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DNAJC17Q9NVM6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC17Q9NVM6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms