Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GINM1Q9NU53 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GINM1Q9NU53 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms