Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KRT82Q9NSB4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT82Q9NSB4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT82Q9NSB4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT82Q9NSB4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT82Q9NSB4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT82Q9NSB4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT82Q9NSB4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT82Q9NSB4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT82Q9NSB4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT82Q9NSB4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT82Q9NSB4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT82Q9NSB4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT82Q9NSB4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT82Q9NSB4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT82Q9NSB4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT82Q9NSB4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT82Q9NSB4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT82Q9NSB4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRT82Q9NSB4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT82Q9NSB4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT82Q9NSB4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT82Q9NSB4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT82Q9NSB4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT82Q9NSB4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT82Q9NSB4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT82Q9NSB4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT82Q9NSB4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT82Q9NSB4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT82Q9NSB4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT82Q9NSB4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT82Q9NSB4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT82Q9NSB4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT82Q9NSB4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRT82Q9NSB4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms