Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
INCENPQ9NQS7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms