Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
A4GALTQ9NPC4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms