Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVK-5Q9HDB9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVK-5Q9HDB9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVK-5Q9HDB9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVK-5Q9HDB9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVK-5Q9HDB9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVK-5Q9HDB9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVK-5Q9HDB9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVK-5Q9HDB9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVK-5Q9HDB9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVK-5Q9HDB9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVK-5Q9HDB9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVK-5Q9HDB9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVK-5Q9HDB9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVK-5Q9HDB9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVK-5Q9HDB9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVK-5Q9HDB9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVK-5Q9HDB9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVK-5Q9HDB9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVK-5Q9HDB9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVK-5Q9HDB9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVK-5Q9HDB9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVK-5Q9HDB9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVK-5Q9HDB9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVK-5Q9HDB9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVK-5Q9HDB9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVK-5Q9HDB9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
ERVK-5Q9HDB9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVK-5Q9HDB9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms