Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCF6

TRPM3, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM3Q9HCF6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRPM3Q9HCF6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms