Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8X3

LINC00574, Putative uncharacterized protein LINC00574, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00574Q9H8X3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00574Q9H8X3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00574Q9H8X3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms