Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NRDE2Q9H7Z3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NRDE2Q9H7Z3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms