Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
REEP4Q9H6H4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms