Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLMPQ9H6B4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLMPQ9H6B4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms