Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CIPCQ9C0C6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
CIPCQ9C0C6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CIPCQ9C0C6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CIPCQ9C0C6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CIPCQ9C0C6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CIPCQ9C0C6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CIPCQ9C0C6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CIPCQ9C0C6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CIPCQ9C0C6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CIPCQ9C0C6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CIPCQ9C0C6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CIPCQ9C0C6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CIPCQ9C0C6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CIPCQ9C0C6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CIPCQ9C0C6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CIPCQ9C0C6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CIPCQ9C0C6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CIPCQ9C0C6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CIPCQ9C0C6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CIPCQ9C0C6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CIPCQ9C0C6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CIPCQ9C0C6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CIPCQ9C0C6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CIPCQ9C0C6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CIPCQ9C0C6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CIPCQ9C0C6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CIPCQ9C0C6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CIPCQ9C0C6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CIPCQ9C0C6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CIPCQ9C0C6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CIPCQ9C0C6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CIPCQ9C0C6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CIPCQ9C0C6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CIPCQ9C0C6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CIPCQ9C0C6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CIPCQ9C0C6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CIPCQ9C0C6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CIPCQ9C0C6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CIPCQ9C0C6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
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