Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PLVAPQ9BX97 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLVAPQ9BX97 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms