Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NUP58Q9BVL2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NUP58Q9BVL2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms