Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPOQ9BU64 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms