Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAGR1Q9BTK6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms