Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MESP1Q9BRJ9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MESP1Q9BRJ9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms