Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
FYCO1Q9BQS8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms