Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK3Q9BQ16 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms