Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RBBP8Q99708 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RBBP8Q99708 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms