Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIN3AQ96ST3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SIN3AQ96ST3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms