Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRAMP1Q96RY5 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRAMP1Q96RY5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms