Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARXQ96QS3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms