Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC4A9Q96Q91 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC4A9Q96Q91 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms