Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CFAP57Q96MR6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CFAP57Q96MR6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CFAP57Q96MR6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CFAP57Q96MR6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CFAP57Q96MR6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CFAP57Q96MR6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CFAP57Q96MR6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CFAP57Q96MR6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CFAP57Q96MR6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CFAP57Q96MR6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP57Q96MR6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms