Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NSMCE2Q96MF7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NSMCE2Q96MF7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms