Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX22Q96L94 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms