Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC34Q96HJ3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC34Q96HJ3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms