Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPNQ96H22 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms