Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MFSD3Q96ES6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MFSD3Q96ES6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MFSD3Q96ES6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MFSD3Q96ES6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MFSD3Q96ES6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MFSD3Q96ES6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MFSD3Q96ES6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MFSD3Q96ES6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MFSD3Q96ES6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
MFSD3Q96ES6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
MFSD3Q96ES6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
MFSD3Q96ES6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MFSD3Q96ES6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms