Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HDAC11Q96DB2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HDAC11Q96DB2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HDAC11Q96DB2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HDAC11Q96DB2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HDAC11Q96DB2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HDAC11Q96DB2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HDAC11Q96DB2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HDAC11Q96DB2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HDAC11Q96DB2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HDAC11Q96DB2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HDAC11Q96DB2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HDAC11Q96DB2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HDAC11Q96DB2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HDAC11Q96DB2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HDAC11Q96DB2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HDAC11Q96DB2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HDAC11Q96DB2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC11Q96DB2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC11Q96DB2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC11Q96DB2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC11Q96DB2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC11Q96DB2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC11Q96DB2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC11Q96DB2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC11Q96DB2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC11Q96DB2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC11Q96DB2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC11Q96DB2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC11Q96DB2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC11Q96DB2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC11Q96DB2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC11Q96DB2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC11Q96DB2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC11Q96DB2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC11Q96DB2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC11Q96DB2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC11Q96DB2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HDAC11Q96DB2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC11Q96DB2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC11Q96DB2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC11Q96DB2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC11Q96DB2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC11Q96DB2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC11Q96DB2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDAC11Q96DB2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms