Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NMD3Q96D46 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms