Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMIGD2Q96BF3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms