Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms