Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CELF1Q92879 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CELF1Q92879 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms