Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAD50Q92878 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms