Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSNK2A3Q8NEV1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2A3Q8NEV1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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