Protein–RNA interactions for Protein: Q86V35

CABP7, Calcium-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP7Q86V35 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CABP7Q86V35 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CABP7Q86V35 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CABP7Q86V35 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CABP7Q86V35 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CABP7Q86V35 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CABP7Q86V35 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CABP7Q86V35 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CABP7Q86V35 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CABP7Q86V35 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CABP7Q86V35 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CABP7Q86V35 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP7Q86V35 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP7Q86V35 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP7Q86V35 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP7Q86V35 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP7Q86V35 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP7Q86V35 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP7Q86V35 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP7Q86V35 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP7Q86V35 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP7Q86V35 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP7Q86V35 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP7Q86V35 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP7Q86V35 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP7Q86V35 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP7Q86V35 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP7Q86V35 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP7Q86V35 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP7Q86V35 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP7Q86V35 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP7Q86V35 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP7Q86V35 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP7Q86V35 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP7Q86V35 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP7Q86V35 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CABP7Q86V35 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CABP7Q86V35 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CABP7Q86V35 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms