Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APTXQ7Z2E3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
APTXQ7Z2E3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms