Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAXIP1Q6ZW49 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PAXIP1Q6ZW49 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAXIP1Q6ZW49 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAXIP1Q6ZW49 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAXIP1Q6ZW49 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAXIP1Q6ZW49 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAXIP1Q6ZW49 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAXIP1Q6ZW49 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAXIP1Q6ZW49 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PAXIP1Q6ZW49 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAXIP1Q6ZW49 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAXIP1Q6ZW49 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAXIP1Q6ZW49 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PAXIP1Q6ZW49 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAXIP1Q6ZW49 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAXIP1Q6ZW49 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PAXIP1Q6ZW49 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAXIP1Q6ZW49 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAXIP1Q6ZW49 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAXIP1Q6ZW49 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PAXIP1Q6ZW49 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PAXIP1Q6ZW49 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAXIP1Q6ZW49 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms