Protein–RNA interactions for Protein: Q6XXX2

LINC00114, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00114, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00114Q6XXX2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00114Q6XXX2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms