Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A10Q6U841 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms