Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6P435 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6P435 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6P435 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6P435 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6P435 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6P435 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6P435 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6P435 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6P435 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6P435 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6P435 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6P435 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6P435 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6P435 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6P435 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6P435 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6P435 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6P435 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6P435 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6P435 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6P435 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6P435 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6P435 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6P435 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6P435 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6P435 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6P435 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6P435 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6P435 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6P435 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6P435 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6P435 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6P435 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6P435 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6P435 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6P435 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6P435 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6P435 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6P435 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6P435 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6P435 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6P435 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6P435 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6P435 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6P435 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6P435 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6P435 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6P435 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6P435 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6P435 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6P435 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6P435 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6P435 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6P435 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6P435 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6P435 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6P435 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6P435 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6P435 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6P435 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6P435 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6P435 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6P435 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6P435 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6P435 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6P435 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6P435 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6P435 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6P435 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6P435 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6P435 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6P435 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6P435 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6P435 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6P435 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6P435 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6P435 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6P435 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6P435 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6P435 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6P435 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6P435 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6P435 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6P435 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6P435 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6P435 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6P435 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6P435 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6P435 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6P435 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6P435 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6P435 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6P435 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6P435 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6P435 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6P435 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6P435 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6P435 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6P435 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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