Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TTC41PQ6P2S7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC41PQ6P2S7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms